Modul: Mustererkennung mit Anwendungen in der Genomforschung

Vorlesung: Mustererkennung mit Anwendungen in der Genomforschung

Aktuelles
    DAS HIS/LSF ist für Anmeldungen geschlossen, Interessenten melden sich per bitte per Mail
    an Frau Rennwanz (rennwanz@uni-duesseldorf.de)

Dozent

Prof. Dr. Alice McHardy

Betreuer

Sebastian Konietzny, Lars Steinbrück und Christina Tusche

Modulart

   Wahlpflicht- oder Schwerpunktmodul

Studiengang

   Bachelor-Studiengang Informatik
   Master-Studiengang Informatik (Bereich Praktische/Technische Informatik)

Kreditpunkte

   15

Lehrveranstaltungen
    Die Veranstaltung wird als Block in der Zeit vom 10.02. - 28.02.2012, 08:30 - 18:30 Uhr
    angeboten.
     - Vorlesung: 4 SWS, 08:30 - 10:30 und 13:30 - 15:30 Uhr, Raum 25.02.01.25
     - Übung: 2 SWS, 10:30 - 12:30 Uhr, Raum 25.02.01.25
     - Praktische Übung: 2 SWS, 15:30 - 17:30 Uhr, Raum 25.02.01.25

Inhalte und Qualifikationsziele
     - Methoden der Mustererkennung
     - Markerdetektion aus Krebsgenomdaten
     - Taxonomisches Assignment von Metagenomen
     - Methoden zur Funktionsannotation

In dieser Vorlesung werden Verfahren des statistischen Lernens und Mustererkennung vorgestellt sowie aktuelle Anwendungsbeispiele aus den Forschungsbereichen Meta- und Krebsgenomik. Der theoretische Teil orientiert sich an dem Buch "Pattern Classification" von R. Duda, P. Hart und D. Stork. Der angewandte Teil beschäftigt sich mit aktuellen Forschungsarbeiten der letzten fünf Jahre. Im ersten Teil werden Verfahren vorgestellt, wie die Bayes'sche Entscheidungstheorie, Maximum-Likelihood Parameterschätzung, nichtparametrische Techniken, lineare Entscheidungsfunktionen, nichtmetrische Methoden, Evaluierungskriterien und Experiment-Design, Verfahren zur Merkmalauswahl sowie Clustering-Verfahren. Begleitend hierzu werden aktuelle, auf diesen Techniken basierende, bioinformatische Methoden aus der Meta- und Krebsgenomik vorgestellt.

Empfohlene Literatur
     Duda, R.O., Hart, P.E., Stork, d.G. Pattern Classification. John Wiley & Sons, New York.

Verwendbarkeit des Moduls
     Wahlpflichtmodul oder Schwerpunktmodul im Bachelor-Studiengang Informatik;
     Wahlpflichtmodul oder Schwerpunktmodul im Master-Studiengang Informatik
 
Teilnahmevoraussetzungen
     Modul "Grundlagen der Softwareentwicklung und Programmierung" (Informatik 1)
     Modul "Grundlagen der Technischen Informatik" (Informatik 2)
     Modul "Lineare Algebra I"

Voraussetzungen für die Vergabe von Kreditpunkten
     Aktive und erfolgreiche Mitwirkung in den Übungen und im Programmierpraktikum;
     Prüfung zu Vorlesung und Übungen am Ende des Semesters (schriftlich oder mündlich - wird
     jeweils zu Beginn des Semesters angekündigt).

Häufigkeit des Angebots, modulare Schiene
     Jedes Studienjahr, in der Regel im Wintersemester

Modulbeauftragter
     Prof. Dr. Alice McHardy

Themen & Folien, Übungen, Praktische Übungen
    

Vorlesungsfolien und Übungszettel stehen im passwortgeschützeten Bereich zur Verfügung.